Google DeepMind 为 Antigravity 推出化学信息学技能
Google DeepMind 为 Google Antigravity 发布一套化学信息学技能(Cheminformatics Skills),基于 RDKit 并接入 ChEMBL 与 PubChem,由语言模型负责任务编排与科学推理、确定性化学工具执行分子计算。以肺癌药物为例,智能体在约一小时内检索数千个化合物、完成匹配分子对分析并训练效力预测模型,还提出带合成路线的新型刚性化大环分子设计。团队同时说明,稀疏数据、实验室间检测噪声和窄动态范围会限制预测精度,计算设计只是可验证的假设,仍需实验合成验证。该技能已在 Antigravity 上线,安装 Science 插件即可使用,并向 1 万名科学家提供 6 个月最高用量档免费名额。
变为一个协作式科学工作台,使计算化学家和实验台化学家都能完全访问本地工具。 这些技能还创造了一种分工:底层语言模型负责工作流编排、数据库导航和科学推理,而确定性化学工具负责执行分子计算。这些技能以 RDKit为基础——这是由全球贡献者社区历经二十年开发的基础开源化学信息学工具包——并结合与 ChEMBL 和 PubChem精选资源的连接器,将领域最佳实践直接编码到智能体的工作流中。 刚性化柔性分子 在这次技术演示中,我们重点介绍一种提高药物效力的经典药物化学技术:刚性化。 药物分子可能很复杂,通常通过可旋转键连接多个子结构。这些键使分子能够扭转成许多三维形状(构象),使其在溶液中变得“柔性”。然而,为了与其靶点结合,柔性分子必须锁定为单一活性形状。失去这种运动自由度会带来熵惩罚,从而削弱结合亲和力并降低效力。 为了解决这个问题,药物化学家通常通过添加新键来刚性化分子。由单个可旋转键连接的两个子结构可以扭转成许多构象,但添加第二个键将它们连接在一起会急剧限制它们在三维空间中的运动方式。通过将那个键放在正确的位置,化学家可以将分子锁定为结合其靶点所需的确切形状。这种策略通常被称为“提前支付
匹配字段正文







